A atuação do Secretariado Executivo está estruturada em três vectores estratégicos: a Concertação Político-Diplomática; a Cooperação em todos os domínios e; a Promoção e Defesa da Língua Portuguesa e da Cultura.
Dirigido pelo Secretário Executivo, que é auxiliado pelo Diretor-Geral, este órgão da CPLP estrutura-se em três departamentos:
- Direção de Cooperação, com Diretor escolhido por concurso público;
- Direção para a Ação Cultural e Língua Portuguesa, com Diretor escolhido por concurso público;
- Assessoria Político-Diplomática, constituída por Assessores colocados pelos Estados-Membros.